Patří sem například nutnost spravovat odboj v rámci každého kontaktovaného regionu zvlášť. Každý region má navíc určitý počet rebelů, které můžete přiřadit na jeden ze tří úkolů. Buď mohou hledat suroviny, rekrutovat nové vojáky i rebely, nebo sbírat informace, na jejichž základě vám pak hra generuje nové mise.
Do každého z regionů můžete také poslat jednoho „poradce“ – vědce, inženýra či vojáka. Takový poradce má pak na svou oblast v daném regionu pozitivní vliv, a navíc může zvýšit jeho obranyschopnost sebráním adventího MEC a jeho předělání skrze perk Full Override.
Počítat byste měli ale také s možnou smrtí rebelů během odplaty, jiných misí a také s možností, že jeden z rebelů může být jen Faceless v přestrojení. Vývojáři nadělí Adventu také novou umělou inteligenci, která se bude snažit přesunout jednotky z vedlejších regionů do vaší lokace.
A pokud se bude v některém z regionů cítit Advent pevný v kramflecích, nebude s vybudováním výzkumných budov váhat. V případě, kdy mu takový region zaberete, se pak může o jeho znovuzískání pokoušet silou.
Long War pak přidá ještě možnost vysadit několik posádek najednou, přičemž v takovém případě hrajete každou takovou misi zvlášť. Kdy mod vyjde zatím není jasné, ale tvůrci slíbili, že brzy dodají další detaily.